果园秋季施肥，此时果树处于扎根季节，不仅可以改良土壤，提高树体养分，深扎根，还能促进花芽分化，提高来年坐果率和产量。
果树施肥的时间应选在立秋后落叶前，尽早进行，此时气温高、雨量多，基肥有充足的时间分解，叶片功能尚未衰退，有较强的光合功能，养分回流到根中，因为果树秋梢的停长时间大约在9月中旬左右，根系进入生长高峰，此时施肥果树根系吸收最多，施基肥利用率最大。
为什么说秋施基肥断根好处多多？可以肯定的是秋施基肥只有好处，没有坏处。
秋施基肥或多或少的造成断根，此时正是根系发育的高峰期，伤根容易愈合，果农不必担忧。
从一个角度分析，断根相当于对根系进行修剪，其修剪反应和树上短截一样，在伤口下会长出大量的新根。原来的一条根变成了十来八条新根，原来的老根变成了新根。根系数量增加了，根系“返老还童”了，来年吸收养分的能力自然就会增强。果树的根系是分级次的。原来的老根已经进化为输导根，输导根的作用主要是输送养分。断根后新长出的根叫生长根，生长根是吸收根的母根。也就是说，明年的吸收根主要在生长根上不断长出来。吸收根寿命很短，一般不会超过一个月，只有生长根上才能源源不断地长出吸收根来，不至于出现吸收根大量死亡、树上养分接续不上的现象。生产上很多果树的阶段性缺素症其实就与吸收根阶段性缺失紧密相关。
从另一个角度分析，断根，其实是人造环境胁迫的一种，此时还差一种特殊状态下的硫元素，才能开启作物的次生代谢途径，两个条件缺一不可。