配置盆土一般取熟化的田园土4份、河沙2份、草木灰1份，充分混合均匀后碾细过筛。盆土在使用前应进行消毒处理，一般在其中掺入少量硫磺粉混合均匀即可。每次倒盆换土时，可根据果树的生长幅度、根球大小及造型需要等情况，更换适宜的盆器。
授粉与坐果
春季是果树盆景君子兰花木的一个重要时期，其授粉情况直接影响到果树挂果和观赏。
这期间，果树盆景要摆放在通透性较好的地方，以便吸引蜜蜂等小昆虫前来授粉，同时要避免使用农药或在其周围摆放刺激性物品，以免影响蜜蜂等小昆虫前来授粉。同时，要多观察果树授粉情况，在自然授粉效果不理想的情况下，可以人工授粉，以提高坐果率。
像苹果、梨等果树盆景坐果后，一个柄上要挂5至7个果子，如任其生长，势必会影响到最后的果实质量与观赏效果，这时要有选择地进行疏果。
根据果树盆景造型需要和果实分布情况，一般每簇保留1至2个比较强壮的果实，其他弱小的全部从其基部剪除。
肥水管理
由于果树的根系只能从盆中吸收营养，仅靠盆土中的营养不能满足果树生长发育的需要，因此在果树生长期必须注重肥水管理，基肥以有机肥为主，可以给芝麻饼加水后密封发酵，发酵好后的肥水再兑清水浇灌。
把握薄肥勤施的原则，肥水添加以每周2至3次为宜，期间可适当添加复合肥。到了观赏期，果实已经成熟，过多的肥水只会让果实早熟早落，缩短观赏时间，故应停止浇肥水，清水也要适当减少。在果树休眠期，果树停止生长，故要控制好盆土水分，既不能太湿，又不能太干，以盆土不过干为宜。
病虫害防治
在盆栽果树病虫害防治上,要坚持预防为主、防治结合的原则。在冬季果树落叶后和春季萌芽前，可喷施3至5次石硫合剂，起到预防效果;在生长季节，需每隔20天至30天喷施70%的甲基托布津可湿性粉剂800倍液，或65%代森锰锌可湿性粉剂500倍液防病;可用2。
5%扑虱蚜1800倍液、20%白螨朴2000倍液喷施，防治盆景果树的蚜虫、红蜘蛛等害虫。
盆景造型
果树盆景应有一定的造型和意境。按果树种类和品种特性，可将果树盆景塑造出多种造型，如自然圆头形、塔形、双枝鹿角形、三枝杯状形、垂柳形、龙曲形等。
在树形塑造上，既要有利于盆栽果树结果，又要有可供观赏的价值。通常采用的促花致矮、整形修剪的措施有抹芽、摘心、拿枝、曲枝、环割、回缩、拉枝等。也可通过开张枝条角度和疏剪徒长枝、密生枝、无效枝等方法增强光照，将果树盆景打造出理想的造型。在嫁接成活正常生长后，为增强盆景的苍老性，可用嫁接刀在树干上刻几条曲线。
在生长季节，可用绑丝缠在果树枝条上，固定出所需树形。另外，还可使用药物促使树体矮化，例如在果树盆景的生长期(夏季)，叶面喷施植物生长延缓剂2至3次，如多效唑、B9、矮壮素等，可使枝条粗壮、节间变短、植株矮化。